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Publicação
Reavaliação dos nichos ecológicos de streptococcus pneumoniae em adultos com mais de 60 anos por PCR em tempo real
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Resumo(s)
Streptococcus pneumoniae é uma bactéria que faz parte da flora comensal do trato respiratório superior. Os estudos de colonização por S. pneumoniae em idosos são escassos mas estão a ganhar uma importância crescente, dado o aumento da esperança média de vida da população em geral e o facto da incidência da doença pneumocócica ser particularmente elevada neste grupo etário.
O objetivo deste estudo foi avaliar a prevalência de colonização da nasofaringe e orofaringe por S. pneumoniae, em adultos com mais de 60 anos, por amplificação em tempo real de dois genes específicos, lytA e piaA. Investigaram-se duas coleções de amostras anteriormente caracterizadas utilizando apenas o método convencional de cultura: uma correspondente às amostras de 78 indivíduos residentes num lar de idosos, e outra correspondente às amostras de 200 indivíduos selecionadas aleatoriamente de um estudo realizado na comunidade. Foi ainda determinado o serótipo presente nas amostras positivas para S. pneumoniae recorrendo a PCR convencional e sequenciação de fragmentos de genes capsulares.
Observou-se uma taxa de colonização mais elevada na orofaringe do que na nasofaringe, havendo vantagem em investigar a prevalência de colonização nas duas localizações anatómicas. A prevalência de colonização por S. pneumoniae aumentou significativamente na coleção da amostra aleatória com uso da PCR em tempo real (9,0% vs 3,5%; p=0,02). No lar de idosos a prevalência de colonização foi mais elevada, não sendo, no entanto, estatisticamente significativa a diferença relativamente ao estudo anterior (20,5% vs 16,7%; p = 0,54). A diversidade de serótipos foi elevada em ambas as coleções e globalmente comparável com os resultados obtidos anteriormente por métodos tradicionais de cultura.
Em conclusão, no estudo de portadores de S. pneumoniae em adultos, onde a densidade de colonização é frequentemente baixa, a utilização de métodos de deteção com uma sensibilidade muito superior à da cultura é particularmente relevante.
Streptococcus pneumoniae is a commensal bacterium that inhabits the upper respiratory tract. S. pneumoniae colonization studies in the elderly are scarce but are becoming increasingly important, since the population life expectancy in general is increasing and the incidence of pneumococcal disease is particularly high in this age group. The aim of this study was to evaluate the prevalence of nasopharyngeal and oropharyngeal colonization by S. pneumoniae, in adults aged over 60 years old, by real-time amplification of two specific genes, lytA and piaA. Two collections of samples previously characterized by conventional culture were investigated: one corresponding to samples of 78 individuals living in a retirement home and other corresponding to samples of 200 individuals randomly selected from a study conducted in the community. S. pneumoniae serotypes present in positive samples were determined by PCR and, if needed, by sequencing of fragments of capsular genes. A higher colonization rate in the oropharynx than in the nasopharynx was observed. Still, the combined screening of the two anatomical sites gave the best sensitivity. Use of real-time PCR resulted in a significant increase in the detection of S. pneumoniae colonization in the random sample collection (9.0% vs 3.5%; p=0.02). In the retirement home collection, the colonization prevalence was also higher when real-time PCR was used, however the difference was not statistically significant when compared to culture-based methods (20.5% vs 16.7%; p = 0.54). Serotype diversity was high in both collections and globally comparable with the results previously obtained by traditional culture methods. In conclusion, the study of S. pneumoniae carriage in adults, where colonization density is often low, benefits significantly from the use of highly sensitivity methods such as real-time PCR.
Streptococcus pneumoniae is a commensal bacterium that inhabits the upper respiratory tract. S. pneumoniae colonization studies in the elderly are scarce but are becoming increasingly important, since the population life expectancy in general is increasing and the incidence of pneumococcal disease is particularly high in this age group. The aim of this study was to evaluate the prevalence of nasopharyngeal and oropharyngeal colonization by S. pneumoniae, in adults aged over 60 years old, by real-time amplification of two specific genes, lytA and piaA. Two collections of samples previously characterized by conventional culture were investigated: one corresponding to samples of 78 individuals living in a retirement home and other corresponding to samples of 200 individuals randomly selected from a study conducted in the community. S. pneumoniae serotypes present in positive samples were determined by PCR and, if needed, by sequencing of fragments of capsular genes. A higher colonization rate in the oropharynx than in the nasopharynx was observed. Still, the combined screening of the two anatomical sites gave the best sensitivity. Use of real-time PCR resulted in a significant increase in the detection of S. pneumoniae colonization in the random sample collection (9.0% vs 3.5%; p=0.02). In the retirement home collection, the colonization prevalence was also higher when real-time PCR was used, however the difference was not statistically significant when compared to culture-based methods (20.5% vs 16.7%; p = 0.54). Serotype diversity was high in both collections and globally comparable with the results previously obtained by traditional culture methods. In conclusion, the study of S. pneumoniae carriage in adults, where colonization density is often low, benefits significantly from the use of highly sensitivity methods such as real-time PCR.
Descrição
Palavras-chave
Microbiologia médica Bacteriologia Streptococus pneumoniae Colonização Serótipo População sénior PCR em tempo real
Contexto Educativo
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Editora
Instituto de Higiene e Medicina Tropical