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Publicação
Proteomic Insights into non-invasive biomarkers for clear cell renal cell carcinoma
| Nome: | Descrição: | Tamanho: | Formato: | |
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Orientador(es)
Resumo(s)
Renal cell carcinoma (RCC) is a prevalent urological malignancy, with rising incidence particularly in developed countries. Current diagnostic approaches, such as CT imaging, are costly, and invasive biopsies carry significant risks. Urine proteomics offers a promising, non-invasive alternative for detecting RCC-specific biomarkers, enhancing early diagnosis, monitoring recurrence, and potentially reducing healthcare
costs associated with RCC management.
In this study, we employed label-free quantitative proteomics to analyze the urine proteomes of patients with clear-cell RCC (ccRCC), revealing significant differences in protein expression across ccRCC, benign prostatic hyperplasia (BPH), and healthy control groups. Our methodology demonstrated high reproducibility, with relative standard deviations (RSDs) below 10% in most technical replicates. A total of 1,084 urinary proteins were quantified, with 86% ± 15, 84% ± 7, and 89% ± 3 of the proteins in the healthy control, BPH, and RCC groups, respectively, having RSD < 10%. We identified 33 proteins consistently expressed in both tumor tissues and urine, highlighting their diagnostic potential. Notable proteins, including ORM1, IGHG2, and
SERPINA3, were highly expressed in both ccRCC tissues and urine, making them promising candidates as non-invasive biomarkers for ccRCC. Further analysis revealed proteins such as CD33, SIRPB1, FABP5, and LAMP3, which are involved in immune evasion, metabolic alterations, and tumor progression, underscoring their potential as diagnostic markers and therapeutic targets. Moreover, by integrating our data with drug
databases, we identified 17 druggable proteins, including PARP1, G6PD, and LDHA, highlighting new therapeutic targets. Drugs like Gemtuzumab, Magrolimab, Belzutifan, Caplacizumab, Sunitinib, Pazopanib, and Axitinib offer potential for personalized treatments, targeting molecular pathways such as glycolysis and Pentose Phosphate Pathway, and creating opportunities for drug repurposing and combination therapies in
ccRCC treatment. Our findings provide a foundation for non-invasive biomarker discovery and personalized therapeutic strategies to improve ccRCC diagnosis and prognosis.
O carcinoma de células renais (CCR) é uma malignidade urológica prevalente, com incidência crescente, particularmente em países desenvolvidos. Os métodos de diagnóstico atuais, como a imagiologia por TC, são dispendiosos e as biópsias invasivas apresentam riscos significativos. A proteómica urinária surge como uma alternativa promissora e não invasiva para a deteção de biomarcadores específicos do CCR, melhorando o diagnóstico precoce, monitorizando a recorrência e reduzindo potencialmente os custos de saúde associados à gestão do CCR. Neste estudo, utilizámos proteómica quantitativa sem marcação para analisar os proteomas urinários de pacientes com CCR de células claras (ccRCC), revelando diferenças significativas na expressão proteica entre ccRCC, hiperplasia benigna da próstata (HBP) e grupos de controlo saudáveis. A nossa metodologia demonstrou elevada reprodutibilidade, com desvios padrão relativos (RSD) abaixo de 10% na maioria dos replicados técnicos. Foram quantificadas 1.084 proteínas urinárias, com 33 proteínas expressas consistentemente tanto nos tecidos tumorais como na urina, destacando o seu potencial diagnóstico. Proteínas notáveis, como ORM1, IGHG2 e SERPINA3, foram altamente expressas em ambos os tecidos e urina, tornando-se candidatas promissoras como biomarcadores não invasivos para ccRCC. A análise adicional identificou proteínas como CD33, SIRPB1 e FABP5, envolvidas na evasão imunológica e progressão tumoral, sublinhando o seu potencial como marcadores diagnósticos e alvos terapêuticos. Além disso, identificámos 17 proteínas alvo de fármacos, incluindo PARP1, G6PD e LDHA, oferecendo novas oportunidades terapêuticas. Fármacos como Sunitinib, Pazopanib e Axitinib mostraram-se opções terapêuticas promissoras ao direcionar vias moleculares. Os nossos resultados apoiam a descoberta de biomarcadores não invasivos e terapias personalizadas para melhorar o diagnóstico e tratamento do ccRCC.
O carcinoma de células renais (CCR) é uma malignidade urológica prevalente, com incidência crescente, particularmente em países desenvolvidos. Os métodos de diagnóstico atuais, como a imagiologia por TC, são dispendiosos e as biópsias invasivas apresentam riscos significativos. A proteómica urinária surge como uma alternativa promissora e não invasiva para a deteção de biomarcadores específicos do CCR, melhorando o diagnóstico precoce, monitorizando a recorrência e reduzindo potencialmente os custos de saúde associados à gestão do CCR. Neste estudo, utilizámos proteómica quantitativa sem marcação para analisar os proteomas urinários de pacientes com CCR de células claras (ccRCC), revelando diferenças significativas na expressão proteica entre ccRCC, hiperplasia benigna da próstata (HBP) e grupos de controlo saudáveis. A nossa metodologia demonstrou elevada reprodutibilidade, com desvios padrão relativos (RSD) abaixo de 10% na maioria dos replicados técnicos. Foram quantificadas 1.084 proteínas urinárias, com 33 proteínas expressas consistentemente tanto nos tecidos tumorais como na urina, destacando o seu potencial diagnóstico. Proteínas notáveis, como ORM1, IGHG2 e SERPINA3, foram altamente expressas em ambos os tecidos e urina, tornando-se candidatas promissoras como biomarcadores não invasivos para ccRCC. A análise adicional identificou proteínas como CD33, SIRPB1 e FABP5, envolvidas na evasão imunológica e progressão tumoral, sublinhando o seu potencial como marcadores diagnósticos e alvos terapêuticos. Além disso, identificámos 17 proteínas alvo de fármacos, incluindo PARP1, G6PD e LDHA, oferecendo novas oportunidades terapêuticas. Fármacos como Sunitinib, Pazopanib e Axitinib mostraram-se opções terapêuticas promissoras ao direcionar vias moleculares. Os nossos resultados apoiam a descoberta de biomarcadores não invasivos e terapias personalizadas para melhorar o diagnóstico e tratamento do ccRCC.
Descrição
Palavras-chave
Renal Cell Carcinoma Non-invasive Biomarkers Urine Proteomics Benign Prostatic Hyperplasia Therapeutic Targets