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Publicação
Processamento de Imagem de Microscópio para Análise de Biópsia
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| 4.28 MB | Adobe PDF |
Autores
Orientador(es)
Resumo(s)
No âmbito da patologia, o diagnóstico de doenças como o cancro passa pela análise de lâminas microscópicas. Conquanto, quando digitalizadas, as imagens resultantes exibem uma definição extraordinariamente alta, tipicamente da ordem das dezenas de gigapixels (109 pixels), necessi-tando de vários gigabytes de memória para o seu processamento. A dimensão destas imagens dificulta significativamente a aplicação de qualquer algoritmo de processamento de imagem e, consequentemente, qualquer análise automática. A falta de ferramentas adequadas leva a que a análise seja efetuada, preferencialmente, sobre a lâmina física, utilizando o microscópio ótico convencional, um processo inerentemente subjetivo. Neste enquadramento, o presente projeto surgiu de uma necessidade manifestada pelo Instituto de Patologia e Imunologia Molecular da Universidade do Porto – Ipatimup. Incorporado na área de Imagem Biomédica, pretendeu-se col-matar a carência de uma ferramenta de processamento de imagens de lâminas de biópsia. Numa primeira fase, foi desenvolvida uma interface de apoio à análise assistida de imagens microscó-picas de híper-resolução. Ao ser desenvolvida em estreita colaboração com patologistas do Ipa-timup, a interface aborda os principais requisitos de um sistema de patologia digital. Por conse-guinte, proporciona uma apropriada visualização, sem a introdução de atrasos na exibição, o que permite também uma “navegação” mais agradável e eficiente ao longo da imagem, melhorando consequentemente a duração da análise. Esta análise pode ainda ser complementada com a reali-zação e a revisão de anotações e um conjunto de aplicações que facilitam a partilha, a revisão e a análise visual e quantitativa destas imagens de microscopia patológica. A segunda fase abarcou o desenvolvimento de um algoritmo de segmentação automática para identificação de nucleoides em lâminas raspadas da tiroide em campo claro, o que, além de proporcionar uma adequada de-tecção/segmentação de nucleoides, dispõe de um mecanismo de edição, permitindo ao utilizador total liberdade para validar/alterar o resultado. Complementarmente, são fornecidas medidas de características específicas da morfologia e homogeneidade dos nucleoides, informações determi-nantes para a avaliação do estado e evolução do cancro da tiroide. Na sequência, este trabalho poderá, ainda, ser complementado com um algoritmo que, baseando no número de nucleoides detetados e suas morfologias, permita, também, propor um diagnóstico.
Descrição
Palavras-chave
Microscopia Virtual Patologia Digital Híper-Resolução Processamento de Imagem Sub-Amostragem Segmentação Automática