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Publicação
A novel tool for survival analysis in lymphoma patients
| Nome: | Descrição: | Tamanho: | Formato: | |
|---|---|---|---|---|
| 21.66 MB | Adobe PDF |
Autores
Orientador(es)
Resumo(s)
Annually, cancer is responsible for 40% of earlier deaths due to non-communicable
diseases, and this number increases at an annual rate of around 1.6%. These alarming
values make it essential to study this disease at a global level, to help better the lives of
all the affected patients and disseminate prevention when possible.
With the advance in technology and thanks to the influx of patients with digitalised
records that suffer from this disease, there is a greater capability to elaborate a study
about the possible causes and consequences drawn from the patient’s data. Furthermore,
the ability to better the patient’s quality of life by analysing their data and sensitising
them is fundamental in the fight against cancer.
The dissertation focuses on developing a computational tool that enables tha ability
to obtain simple statistics, thanks to classical techniques of survival analysis as well
as the analysis of lymphoma cancer, both Hodgkin and non-Hodgkin lymphomas that
constitute nearly 48% of blood cancers. To determine the factors that influence the study
of the received patients’ database, a preprocessing is done where the descriptive statistics
are obtained using the patients’ database information. After that, Kaplan-Meier estimator
curves are elaborated to determine the relationship between the studied phenomenon
and the different variables present in the database. After taking brief conclusions from
the obtained variables and subsequent descriptive analysis, an analysis using the Kaplan-
Meier estimator is done. The integration of the achieved results is implemented in a tool
that constitutes CLARIFY 1’s project dashboard.
This dissertation was created in conjunction with the CLARIFY European project, led
by the oncology medical team of University Hospital Puerta Hierro de Majadahonda.
Anualmente, o cancro é responsável por 40% das mortes precoces devido a doenças não transmissíveis, e este valor aumenta anualmente cerca de 1.6%. Estes valores alarman- tes fazem o estudo desta doença um foco fundamental a nível global de modo a melhorar a vida de todos os pacientes e disseminar prevenção a quando possibilidade do mesmo. Com o avançar da tecnologia e graças a um influxo de registos digitalizados sobre pacientes que sofrem este tipo de doença, existe uma maior capacidade de elaborar um estudo sobre as possíveis causas e consequências retiradas a partir dos dados de pacientes que passaram por isso. Para além disso, a capacidade de melhorar a qualidade de vida dos pacientes através da análise dos seus dados e da sensibilização dos mesmos é fundamental para uma constante luta contra o cancro. Esta dissertação foca-se no desenvolvimento de uma ferramenta computacional que permite aceder de forma simples, a estimativas obtidas a partir de técnicas clássicas de análise de sobrevivência como exemplo de aplicação, foca-se ainda na análise do cancro linfoma tanto Hodgkin como não-Hodgkin, que abrange cerca de 48% dos cancros de sangue. Com o objetivo de averiguar os fatores de risco que influenciam a sobrevivência dos pacientes da base de dados em estudo, é efetuado um pré-processamento dos dados, onde são obtidas estatísticas descritivas da base de dados de pacientes e produzidas estatísticas das curvas de sobrevivência com recurso ao estimador de Kaplan-Meier de modo a determinar a relevância das variáveis analisadas da base de dados em relação ao acontecimento analisado. A integração dos resultados obtidos através do estimador Kaplan-Meier será integrada numa ferramenta que por sua vez fará parte do Dashboard do projeto do CLARIFY 2. Esta dissertação foi criada em conjunto com o projeto europeu, Clarify, liderado pela equipa médica de oncologia do Hospital Universitário Puerta Hierro de Majadahonda
Anualmente, o cancro é responsável por 40% das mortes precoces devido a doenças não transmissíveis, e este valor aumenta anualmente cerca de 1.6%. Estes valores alarman- tes fazem o estudo desta doença um foco fundamental a nível global de modo a melhorar a vida de todos os pacientes e disseminar prevenção a quando possibilidade do mesmo. Com o avançar da tecnologia e graças a um influxo de registos digitalizados sobre pacientes que sofrem este tipo de doença, existe uma maior capacidade de elaborar um estudo sobre as possíveis causas e consequências retiradas a partir dos dados de pacientes que passaram por isso. Para além disso, a capacidade de melhorar a qualidade de vida dos pacientes através da análise dos seus dados e da sensibilização dos mesmos é fundamental para uma constante luta contra o cancro. Esta dissertação foca-se no desenvolvimento de uma ferramenta computacional que permite aceder de forma simples, a estimativas obtidas a partir de técnicas clássicas de análise de sobrevivência como exemplo de aplicação, foca-se ainda na análise do cancro linfoma tanto Hodgkin como não-Hodgkin, que abrange cerca de 48% dos cancros de sangue. Com o objetivo de averiguar os fatores de risco que influenciam a sobrevivência dos pacientes da base de dados em estudo, é efetuado um pré-processamento dos dados, onde são obtidas estatísticas descritivas da base de dados de pacientes e produzidas estatísticas das curvas de sobrevivência com recurso ao estimador de Kaplan-Meier de modo a determinar a relevância das variáveis analisadas da base de dados em relação ao acontecimento analisado. A integração dos resultados obtidos através do estimador Kaplan-Meier será integrada numa ferramenta que por sua vez fará parte do Dashboard do projeto do CLARIFY 2. Esta dissertação foi criada em conjunto com o projeto europeu, Clarify, liderado pela equipa médica de oncologia do Hospital Universitário Puerta Hierro de Majadahonda
Descrição
Palavras-chave
Lymphoma cancer Hodgkin Lymphoma non-Hodgkin Lymphoma survival analysis Kaplan-Meier estimator og-rank test