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Imaging tools for automatic biomarkers analysis to evaluate progression in intermediate age-related macular degeneration
Publication . Lashkov, Vasilli; Matela, Nuno; Tenreiro, Sandra Isabel Nogueira
Age-related macular degeneration (AMD) is a major cause of vision loss in elderly, with no effective treatments available. Ophthalmologists rely on retinal imaging, but manual comparison of features is time-consuming and subjective. We aimed to perform an automated longitudinal analysis of AMD biomarkers using previously developed by our group software. Here, advanced image processing and existing algorithms were used for quantifying drusen features at different timepoints, giving insights into disease progression and software’s limitations.
Optical Coherence Tomography (OCT) images were acquired using the SPECTRALIS platform (Heidelberg Engineering). The study utilized a total of 8 SD-OCT volumes obtained from 4 patients with intermediate AMD. Images quality was ensured by excluding scans with artifacts or those that could not be processed by the software. MATLAB was used for custom image analysis.
The results demonstrated an overall increase in drusen number and size over the follow-up period, consistent with known patterns of AMD progression. However, drusen volume changes were less consistent, possibly reflecting variability in disease mechanisms, patient-specific factors, or software limitations. Hyperreflective foci (HRF) were observed, but due to the small sample size, no clear patterns in their behavior over time could be established. The study's small sample size and variability in drusen dynamics limited the statistical analysis of the findings. Additionally, possible errors in automated segmentation could have contributed to these inconsistencies.
While the study identifies trends in drusen dynamics and their potential role in AMD progression, the limited sample size prevents drawing definitive conclusions, underscoring the need for further research. We also addressed the software’s limitations and proposed directions for future investigation. Follow-up studies should focus on larger sample sizes, incorporate a rigorous manual validation to capture the full range of drusen evolution, and expand the analysis to include other important AMD biomarkers, such as different phenotypes of OCT Reflective Drusen Substructures (ODS), hyporeflective central drusen, or structural changes in retinal pigment epithelium (RPE), external limiting membrane (ELM) and ellipsoid zone (EZ). With continued development and refinement, automated tools hold significant potential for advancing AMD research and improving disease monitoring.
Determining the role of a candidate peptide hormone ligand-receptor pair during pharate adult development in Drosophila
Publication . Varela, Ednilson Mascarenhas; Gontijo, Alisson M.; Homem, Catarina; Herédia, Fabiana
Resumo: Os péptidos semelhantes à insulina (Ilps) da família Relaxina têm funções importantes na reprodução, desenvolvimento e função do sistema nervoso em várias espécies e sinalizam através de recetores acoplados à proteína G (GPCRs) específicos da Relaxina. Em Drosophila, o Ilp7 é o mais altamente conservado entre os oito Ilps descritos, mas a sua função biológica permanece desconhecida. O Leucine-Rich Repeat-containing GPCR 4 (Lgr4) de Drosophila é um claro ortólogo dos recetores de Relaxina vertebrados, mas qual Ilp de Drosophlia, se houver, atua como seu ligando, ainda está por determinar. Com base na nossa análise filogenética evolutiva, eu hipotetizo que o Dilp7 e o Lgr4 formam um par ligante-recetor em Drosophila. Aqui, incorporamos os genes repórter GAL4 e LexA no locus endógeno do Lgr4 (Lgr4::P2A::GAL4 ou Lgr4::P2A::LexA, respetivamente) e utilizamos estes repórteres para inferir padrões de expressão do Lgr4 durante o desenvolvimento de Drosophila. Descobrimos que a maioria das células positivas para Lgr4 (Lgr4+) no sistema nervoso central (SNC) expressa a proteína de ligação ao ARN elav (embryonic lethal, abnormal vision), um marcador de neurónios pós-mitóticos. Isto sugere que a maioria ou todas as células Lgr4+ são neurónios, não gliais ou outras células no SNC. Ao analisar os dados de sequência dos nossos alelos GAL4 e LexA, descobrimos que existem dois alelos Lgr4 previamente não observados segregando em estirpes de Drosophila. São observadas diferenças nos padrões de expressão do Lgr4 entre estes alelos, particularmente no lobo ótico. A caracterização neuroanatómica identifica células notáveis positivas para Lgr4 na pars intercerebralis (PI), distintas das células produtoras de insulina (IPCs), sugerindo significado funcional. A expressão do Lgr4 também é detetada no gânglio proventricular (PVG), ABLKs e nos sistemas gustativos, indicando expressão extensiva tanto nos sistemas nervosos central quanto periférico, com potenciais funções diversas. Demonstramos que mutantes em Ilp7 ou Lgr4 não apresentam defeitos óbvios em condições laboratoriais normais relativamente ao desenvolvimento, fertilidade e fecundidade. No entanto, mutantes em Ilp7 e Lgr4 exibem comportamento aberrante de evitação da luz e desempenham um papel crucial no final do terceiro instar tardio das larvas, levando-as a selecionar um ambiente escuro para se pupar. Além disso, validamos bioquimicamente que o Ilp7 e o Lgr4 co-imunoprecipitam quando versões epitopadas de ambas as proteínas são expressas ectopicamente em células de Drosophila S2 cultivadas in vitro.
Além disso, confirmamos que a confinamento induz um atraso na expansão da asa de D. melanogaster usando uma configuração diferente (nossas pequenas câmaras nas arenas de filmagem), e descobrimos que as moscas da estirpe mutante Ilp7 (Ilp7[1]) falham em realizar o comportamento de expansão da asa sob confinamento. No entanto, colocar a mutação Ilp7[1] em outro fundo genético (RAL486) eliminou este efeito. Além disso, a redução mediada por RNAi de Ilp7 usando drivers panneuronais e ubíquos não teve efeito ou teve o efeito oposto na expansão da asa sob confinamento. Estes resultados sugerem fortemente que o Ilp7 não é necessário para a expansão da asa. Portanto, concluímos que o fenótipo mutante Ilp7[1] observado sob confinamento é devido a uma alteração genética ou não genética na estirpe w[1118], Ilp7[1]. Os mesmos efeitos inconsistentes foram observados quando mutações no gene codificante do recetor de Ilp7, Lgr4, foram testadas. Portanto, concluímos que a via Ilp7-Lgr4 não é necessária para o comportamento de expansão da asa em situações de confinamento, rejeitando a nossa hipótese.
Advancing Biotherapeutic Manufacturing Through New Purification Strategies
Publication . Fernandes, Rita Patrício; Peixoto, Cristina; Mota, José Paulo
"The bioprocessing of enveloped viral vectors and extracellular vesicles (EVs) has made significant advances in recent years, driven by their growing applications in gene therapy, vaccine development, and regenerative medicine. These biological entities, which include viral vectors such as lentiviruses, retroviruses, and oncolytic viruses, as well as therapeutic EVs, are essential for delivering genetic material and modulating intercellular communication. Their increasing relevance is reflected in the expanding number of clinical trials and therapeutic products leveraging these platforms. For instance, lentiviral vectors (LVs) have become critical tools in gene therapies targeting monogenic disorders and cell-based therapies, while extracellular vesicles are being explored for their potential in drug delivery and immune modulation. (...)"
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Descrição
Palavras-chave
Contribuidores
Financiadores
Entidade financiadora
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Programa de financiamento
Concurso de avaliação no âmbito do Programa Plurianual de Financiamento de Unidades de I&D (2017/2018) - Financiamento Programático
Número da atribuição
UIDP/04462/2020