Conhecer a epidemiologia da infeção por vírus da imunodeficiência humana tipo 2 (VIH-2) em indivíduos residentes em Portugal: o que mudou nas últimas décadas?

Abstract

Resumo: Os principais objetivos deste estudo foram analisar a evolução epidemiológica da infeção por VIH-2 em Portugal utilizando dados demográficos, clínicos e laboratoriais correspondentes a amostras de parturientes infetadas por VIH-2 recebidas no INSA, e ainda, realizar a caracterização molecular do VIH-2 numa amostra de conveniência, com foco na classificação filogenética dos vírus e identificação de mutações de resistência. A análise da amostra global recebida no laboratório entre 2006 e 2023 foi baseada em dados demográficos e clínicos conhecidos. A análise molecular do VIH-2 foi realizada a amostras selecionadas, submetidas a extração de DNA, amplificação por nested-PCR das regiões PR-TR e IN do gene pol e os amplificados sequenciados pelo método de Sanger. As sequências obtidas foram analisadas com vários programas bioinformáticos, construídas as respetivas árvores filogenéticas e realizada a pesquisa de mutações de resistência com ferramentas disponíveis em bases de dados internacionais. A análise dos dados relativos às amostras da população total (n=183) revelou que 16,6% das parturientes infetadas por VIH-2 eram portuguesas, mas observou-se uma clara predominância de mulheres nascidas em África (83,4%), maioritariamente na Guiné-Bissau e na faixa etária dos 30-39 anos. Entre 2006 e 2023 observou-se uma aparente melhoria geral da situação imunológica, com aumento da proporção de mulheres com T CD4+ superior a 500 células/μL e um aumento da taxa de adesão à TARV na gravidez (56,2% para 64,0%), verificando-se ser maior entre mulheres africanas (69,6%) comparativamente a portuguesas (66,7%). Ao longo do tempo, verificou-se uma transição de regimes TARV contendo apenas INTR para regimes de INTR combinados com IIN, sendo que entre 2018 e 2023, este regime foi prescrito a 56,5% das parturientes. A análise da amostra de conveniência selecionada (n=99) revelou ser representativa do total das amostras recebidas no laboratório entre 2011 e 2023, para as variáveis demográficas e clínicas analisadas. A amplificação foi bem-sucedida em 48,5% das amostras para PR-TR e 46,5% das amostras para a IN, sendo todas as sequências classificadas filogeneticamente no grupo A do VIH-2 e excluídas do cluster A2. Observou-se que 12 sequências derivadas de amostras de 12 mulheres apresentavam mutações de interesse, nomeadamente, em 7 de 45 sequências do grupo TR e em 5 de 35 sequências do grupo IN. Três sequências de cada grupo apresentavam mutações acessórias associadas a possível redução da suscetibilidade a antirretrovirais (I75V, V111I e F214L na TR e I84V, A153S na IN). No entanto, em 4 sequências TR e 2 sequências IN foram identificadas mutações de resistência (K70R, Q151M, M184V e S215Y na TR e R263K e N155H na IN). O presente estudo revelou a necessidade de um maior esforço em implementar medidas para incrementar a adesão à TARV, bem como rastreio da infeção VIH-2, no sentido de prevenir a transmissão e melhorar os desfechos clínicos nos doentes. Os resultados produzidos neste estudo podem contribuir para a atualização do conhecimento sobre as características epidemiológicas e moleculares do VIH-2 em Portugal, assim como evidencia a existência de mutações de resistência com impacto no tratamento da infeção.

Abstract: The main objectives of this study were to analyse the epidemiological evolution of HIV-2 infection in Portugal using demographic, clinical and laboratory data corresponding to samples from HIV-2-infected parturients received at INSA, and to conduct the molecular characterisation of HIV-2 in a convenience sample, focusing on the phylogenetic classification of viruses and identification of resistance mutations. The analysis of the overall sample received at the laboratory between 2006 and 2023 was based on known demographic and clinical data. The molecular analysis of HIV-2 was performed on selected samples, subjected to DNA extraction, nested-PCR amplification of the PR-RT and IN regions of the pol gene and the amplified samples sequenced by the Sanger method. The results obtained were discovered with several bioinformatics programs, the respective phylogenetic trees were constructed and the search for resistance mutations was carried out with available international databases. An analysis of data from samples of the total population (n=183) revealed that 16.6% of the parturients infected with HIV-2 were Portuguese, but there was a clear predominance of women born in Africa (83.4%), mostly in Guinea-Bissau and in the age group of 30-39 years. Between 2006 and 2023, an apparent general improvement in the immunological situation was observed, with an increase in the proportion of women with CD4+ T cells above 500 cells/μL and an increase in the rate of adherence to ART during pregnancy (56.2% to 64.0%), which was higher among African women (69.6%) compared to Portuguese women (66.7%). Over time, a transition from ART regimens containing only NRTI to NRTI regimens combined with INSTI was achieved, and between 2018 and 2023, this regimen was prescribed to 56.5% of parturients. The analysis of the selected convenience sample (n=99) proved to be representative of the total samples received in the laboratory between 2011 and 2023, for the demographic and clinical variations analysed. Amplification was successful in 48.5% of the samples for PR-RT and 46.5% of the samples for IN, with all sequences phylogenetically in HIV-2 group A and excluded of cluster A2. It was observed that 12 sequences derived from samples of 12 women presented mutations of interest, namely, in 7 of 45 sequences of the RT group and in 5 of 35 sequences of the IN group. Three sequences from each group presented accessory mutations associated with a possible reduction in susceptibility to antiretrovirals (I75V, V111I and F214L in RT and I84V, A153S in IN). However, resistance mutations were identified in 4 RT sequences and 2 IN sequences (K70R, Q151M, M184V and S215Y in RT and R263K and N155H in IN). This study revealed the need for greater efforts to implement measures to increase adherence to ART, as well as screening for HIV-2 infection, to prevent transmission and improve clinical outcomes in patients. The results produced in this study may contribute to updating knowledge about the epidemiological and molecular characteristics of HIV-2 in Portugal, as well as evidence of the existence of resistance mutations with an impact on the treatment of the infection.