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Publicação

Estudos estruturais de interacções proteína-ligando: aldeído oxidorredutase e tripsina

dc.contributor.advisorSantos-Silva, Teresa
dc.contributor.authorCorreia, Hugo David Cancela
dc.date.accessioned2013-06-05T10:19:47Z
dc.date.available2013-06-05T10:19:47Z
dc.date.issued2012
dc.descriptionDissertação para obtenção do Grau de Mestre em Bioquímica Estrutural e Funcionalpor
dc.description.abstractO conhecimento e compreensão das interacções entre proteínas e ligandos é muitas vezes a base para a resolução de questões complexas a nível biológico. Na presente dissertação são estudadas as proteínas Aldeído Oxidorredutase de Desulfovibrio gigas (DgAOR) e a tripsina de Bos taurus com vários ligandos por Cristalografia de Raios-X. A DgAOR é uma enzima de molibdénio da família da Xantina Oxidase que apresenta a função de catalisar a hidroxilação oxidativa de aldeídos a ácidos carboxílicos. Com o objectivo de se perceber qual a diferença entre as formas activa e inactiva desta enzima, foram realizados estudos cinéticos com ditionito de sódio e sulfureto de sódio, reagentes utilizados na activação de proteínas da mesma família. Os resultados mostraram uma activação inicial seguida de uma inactivação. O modelo cristalográfico determinado nas mesmas condições sugere uma molécula de peróxido de hidrogénio ligada ao átomo de molibdénio do centro activo. Quando comparada com a estrutura obtida usando apenas peróxido de hidrogénio, as semelhanças são notórias reforçando a presença desta espécie a bloquear o centro activo. De modo a elucidar o mecanismo de reacção da enzima, foram executados estudos com diferentes aldeídos, tendo-se observado a interacção entre o cofactor e os substratos, nalguns casos originando os produtos da reacção. A tripsina é uma protease de serina que catalisa a hidrólise de ligações peptídicas. Esta foi utilizada como modelo cristalográfico para o estudo de interacções com cinco compostos desenhados para a inibição da urocinase, uma enzima muito semelhante, da mesma família. Foram obtidas estruturas com os compostos AB1 e JS62 ligados ao centro activo permitindo a visualização das interacções entre estes e os resíduos chave da proteína. O composto AB11 não se ligou à proteína, enquanto que, para os restantes dois compostos, JS67 e SR5, obteve-se densidade electrónica de difícil interpretação no centro activo.por
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/10362/9793
dc.language.isoporpor
dc.publisherFaculdade de Ciências e Tecnologiapor
dc.subjectCristalografia de raios-Xpor
dc.subjectCinética enzimáticapor
dc.subjectInteracções proteína-ligandopor
dc.subjectAldeído oxidorredutasepor
dc.subjectTripsinapor
dc.subjectEspécies reactivas de oxigéniopor
dc.titleEstudos estruturais de interacções proteína-ligando: aldeído oxidorredutase e tripsinapor
dc.typemaster thesis
dspace.entity.typePublication
rcaap.rightsopenAccesspor
rcaap.typemasterThesispor

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