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    <dc:date>2013-05-23T02:03:17Z</dc:date>
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    <title>Infecção por Treponema pallidum: análise serológica e pesquisa de DNA</title>
    <link>http://hdl.handle.net/10362/9633</link>
    <description>Title: Infecção por Treponema pallidum: análise serológica e pesquisa de DNA
Authors: Lino, José Manuel Ferreira
Abstract: RESUMO: A sífilis é uma infecção causada por T. pallidum que pode ser transmitida por via&#xD;
vertical, por contacto sexual ou por sangue, e cujo diagnóstico se baseia na associação&#xD;
entre manifestações clinicas e testes serológicos.&#xD;
Neste estudo utilizaram-se os testes serológicos RPR, TPHA, FTA-Abs, um teste rápido&#xD;
não comercializado (Signal-Spirolipin) que pesquisa anticorpos treponémicos (CDC-T)&#xD;
e não treponémicos (CDC-2) em simultâneo no mesmo dispositivo e uma técnica de&#xD;
PCR-multiplex para a pesquisa de ADN de T. pallidum.&#xD;
Da comparação das técnicas serológicas constatou-se que a sensibilidade dos testes RPR&#xD;
e TPHA foi de 84,5% e 98% respectivamente. A especificidade foi de 77,3% para o&#xD;
teste RPR e de 87,5% para o teste TPHA.&#xD;
Na avaliação do teste rápido a comparação do teste CDC-2 com o teste RPR resultou&#xD;
numa taxa de concordância de 93,1% enquanto que, a do teste CDC-T com o teste&#xD;
TPHA foi de 94,8%. A sensibilidade e especificidade obtidas pelos testes CDC-2 e&#xD;
CDC-T foram de 88,7% e 65% e de 94,9% e 91,3% respectivamente.&#xD;
Considerando o diagnóstico de sífilis activa com base na reactividade simultânea dos&#xD;
testes RPR e TPHA, avaliou-se a sensibilidade do teste rápido utilizando esse mesmo&#xD;
critério. A sensibilidade obtida foi de 98,4% para o teste rápido e de 97,2% para a&#xD;
associação dos testes RPR/TPHA.&#xD;
A técnica de PCR-multiplex apresentou fraca sensibilidade já que em apenas 33% dos&#xD;
casos de sífilis foi identificado ADN de T. pallidum.&#xD;
O teste rápido avaliado apresentou um comportamento idêntico aos testes geralmente&#xD;
utilizados na rotina laboratorial tais como os utilizados neste estudo. Apresenta a&#xD;
vantagem de pesquisar anticorpos treponémicos e não treponémicos, ao contrário dos&#xD;
testes rápidos comercializados que pesquisam apenas anticorpos treponémicos. Não&#xD;
sendo necessário para a sua execução equipamento laboratorial especializado poderá ser de grande utilidade para o clinico a exercer em locais sem laboratório.------------- ABSTRACT: Syphilis is an infection caused by T. pallidum. Transmission may be vertical, through sexual contact or blood.&#xD;
The diagnosis is based in both serology and clinical manifestations. In this study, we used the serological tests RPR, TPHA, FTA-Abs and a non -commercialized rapid test (Signal-Spirolipin) to detect both treponemal (CDC-T) and non – treponemal antibodies (CDC-2) in the same device. T. pallidum DNA was identified with a multiplex PCR technique.&#xD;
In this study, the RPR and TPHA tests sensitivity was 84,5% and 98%, respectively, and the specificity 77,3% for the RPR test and 87,5% for TPHA test, respectively.&#xD;
The concordance rate was 93,1% in the comparison between the RPR and the CDC2 tests and 94,8% between the CDC-T with the TPHA tests. Sensitivity and specificity of the CDC-2 and CDC-T tests were 88,7% and 65% and 94,9% e 91,3%, respectively.&#xD;
Taking into account that the diagnosis of active syphilis is made when both the RPR and TPHA tests are reactive, we evaluated the sensitivity of the rapid test (CDC2 and CDCT) in the diagnosis of active syphilis, using the above described criteria. The sensitivity was 98,4 % for the rapid test and 97,2 % for the association of reactivity in both RPA and TPHA tests.&#xD;
The multiplex PCR technique presented a low sensitivity, with T. pallidum DNA being identified in only 33% of the syphilis cases.&#xD;
The rapid test evaluated in this study presented identical results to the tests generally used in the routine laboratory diagnosis, such as those used here. However, it does have the advantage of detecting both treponemal and non – treponemal antibodies what is not the case of the commercialized rapid test. Furthermore, there is no need of specialized laboratory equipment, which makes it of great utility in regions where such conditions do not exist, as in developing countries.</description>
    <dc:date>2013-01-01T00:00:00Z</dc:date>
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    <title>Comparison of different techniques for mouse transgenesis</title>
    <link>http://hdl.handle.net/10362/9082</link>
    <description>Title: Comparison of different techniques for mouse transgenesis
Authors: Almeida, Joana Paula de Assunção
Abstract: RESUMO: O uso de ratinhos transgénicos em neurociências aumentou consideravelmente nos últimos anos devido ao crescente interesse em compreender o cérebro e a necessidade de solucionar situações clínicas do foro neurológico e psiquiátrico. Para esse efeito, diferentes métodos de produção de animais transgénicos têm sido testados.&#xD;
O objectivo desta tese foi comparar métodos de integração aleatória de um transgene no genoma de ratinhos em termos de eficiência, estabilidade da integração do transgene, número de animais e de horas de trabalho necessárias para cada método. Assim, foi comparado o método mais utilizado - microinjecção pronuclear (PNMI) - com duas outras técnicas cujo desempenho foi considerado promissor – a transferência génica através dos testículos por electroporação e transfecção por lentivírus in vivo. As três técnicas foram realizadas usando um gene repórter sob o controlo de um promotor constitutivo, e depois reproduzidas usando um gene de interesse de modo a permitir obtenção de um animal capaz de ser usado em experimentação laboratorial.&#xD;
O transgene de interesse utilizado codifica uma proteína de fusão correspondendo a uma variante da rodopsina (channelrhodopsin) fundida à proteína enhanced yellow fluorescente protein ((EYFP) resultando num produto designado ChR2-EYFP. Este animal transgénico apresentaria expressão deste canal iónico apenas em células dopaminergicas, o que, com manipulação optogenética, tornaria possivel a activação especifica deste grupo de neurónios e, simultaneamente, a observação do impacto desta manipulação no comportamento num animal em livre movimento. Estas ferramentas são importantes na investigação básica em neurociências pois ajudam a esclarecer o papel de grupos específicos de neurónios e compreender doenças como a doença de Parkinson ou a esquizofrenia onde a função de certos tipos de neurónios de encontra alterada.&#xD;
Quando comparados os três métodos realizados verifica-se que usando um gene repórter PMNI resulta em 31,3% de, a de animais transgénicos obtidos, a electroporação de testículos em 0% e a injecção de lentivírus em 0%. Quando usado o gene de interesse, os resultados obtidos são, respectivamente, 18,8%, 63,9% e 0%.--------------ABSTRACT: The use of transgenic mice is increasing in all fields of research, particularly in neuroscience, due to the widespread need of animal models to solve neurological and psychiatric medical conditions. Different methodologies have been tested in the last decades in order to produce such transgenic animals. The ultimate goal of this thesis is to compare different methods of random integration of a transgene in the genome of mice in terms of efficiency, stability of the transgene integration, number of animals required and the labour intensity of each technique. We compared the most used method – pronuclear microinjection (PNMI) – with two other promising techniques – Testis Mediated Gene Transfer (TMGT) by electroporation and in vivo lentiviral transfection. The three techniques were performed using a reporter gene – green fluorescent protein (GFP), whose transcription was driven by the constitutive cytomegalovirus (CMV) promoter. These three techniques were later reproduced using the tyrosine hydroxylase promoter (TH) and the neuronal manipulator, channelrhodopsin-2 fused to the enhanced yellow fluorescent reporter protein (ChR2-EYFP). The transgenic animal we sough to produce would express the light driven channel only in dopaminergic cells, making possible to specifically activate this group of neurons, while simultaneously observe the behaviour in a freely moving animal. This is a very important tool in basic neuroscience research since it helps to clarify the role of specific groups of neurons, map circuits in the brain, and consequently understand neurological diseases such as Parkinson’s disease or schizophrenia, where the function of certain types of neurons is affected.&#xD;
When comparing the three methods, it was verified that using a reporter gene PNMI resulted in 31.3% of transgenic mice obtained, testis electroporation in 0% and lentiviral injection in 0%. When using the gene of interest, the results obtained were, respectively, 18.8%, 63.9% and 0%.</description>
    <dc:date>2012-01-01T00:00:00Z</dc:date>
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  <item rdf:about="http://hdl.handle.net/10362/5101">
    <title>Contributo para o estudo da infecção congénita pelo vírus citomegálico em Portugal</title>
    <link>http://hdl.handle.net/10362/5101</link>
    <description>Title: Contributo para o estudo da infecção congénita pelo vírus citomegálico em Portugal
Authors: Paixão, Paulo Jorge Pereira Cruz
Abstract: Resumo&#xD;
O vírus citomegálico humano (CMV) é o principal agente de infecção congénita,&#xD;
atingindo cerca de 0.2 a 2.2% de todos os recém-nascidos. As crianças que nascem&#xD;
infectadas por este vírus têm cerca de 11% a 12.7% de probabilidades de apresentarem&#xD;
sintomas e sinais de doença citomegálica ao nascimento, podendo cerca de 40 a 58%&#xD;
destas virem a apresentar sequelas neurológicas permanentes. Das crianças infectadas&#xD;
que terão infecção assintomática no período neo-natal, 5 a 15% poderão vir igualmente&#xD;
a sofrer de sequelas tardias, sobretudo a surdez ou o atraso mental.&#xD;
Em Portugal, desconhece-se a dimensão deste problema. O primeiro objectivo desta&#xD;
dissertação foi, desta forma, a determinação da prevalência através do recurso aos&#xD;
cartões do diagnóstico precoce (“Guthrie cards”), utilizando uma técnica de nested-PCR&#xD;
dirigida para o vírus. Foram estudados 3600 cartões, seleccionados de todo o território&#xD;
nacional (continente e ilhas), de uma forma proporcional ao número de nascimentos em&#xD;
cada distrito, dos quais 38 foram positivos, o que dá uma prevalência de 1.05%&#xD;
(intervalo de confiança para 95%: 0.748-1.446).&#xD;
A revisão sobre a experiência acumulada nos últimos 15 anos, na área do&#xD;
diagnóstico pré-natal, juntamente com um estudo adicional sobre a técnica da avidez,&#xD;
permitiu retirar algumas ilações, nomeadamente que este diagnóstico constitui uma&#xD;
arma diagnostica fiável para a avaliação pré-natal desta infecção congénita e que a&#xD;
selecção dos casos para amniocentese deverá obedecer a indicações serológicas&#xD;
precisas, como a “seroconversão para IgG” ou a “IgM confirmada” (devendo o método&#xD;
de confirmação ser a avidez das IgG com um índice &lt;0,6) e as alterações ecográficas de&#xD;
etiologia não esclarecida.&#xD;
A possibilidade de utilizar pools de urinas para detectar a infecção congénita por&#xD;
CMV foi abordada na terceira parte do trabalho experimental. A metodologia aí descrita&#xD;
teve correlação total com o método de referência, permitindo uma redução bastante&#xD;
significativa nos tempos de execução e nos custos em consumíveis, pelo que abre a&#xD;
possibilidade da sua utilização para o rastreio da infecção congénita por CMV nos&#xD;
recém-nascidos.</description>
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